Janne Malinen aloitti kitaransoiton omien sanojensa mukaan 12-vuotiaana; tyypillisesti heavyrockin innoittamana, tukan kasvatuksella ja yksisormitekniikan harjoittamisella. Vuonna 1987 alkoivat klassisen kitaran opinnot Savonlinnan musiikkiopistossa Pentti Malisen oppilaana. Ammatilliset opinnot päättyivät Sibelius-Akatemiassa vuonna 2001 erinomaisin arvosanoin suoritettuun Musiikin maisterin tutkintoon opettajanaan Jukka Savijoki sekä vuonna 2000 Postgraduate Performance Diploma ja LRAM-opettajatutkinto Lontoon Kuninkaallisesta Musiikkiakatemiasta, jossa opettajina toimivat Michael Lewin, Timothy Walker ja John Mills.

Ura käynnistyi vuonna 1992 jolloin hän nuorimpana osanottajana palkittiin kansallisesti merkittävässä K.V. Leino -kitarakilpailussa Jyväskylässä. Siitä lähtien hän on konsertoitunut useilla kitarafestivaaleilla sekä musiikkijuhlilla kotimaassa ja ulkomailla mm. Englannissa, Saksassa, Italiassa, Virossa ja Yhdysvalloissa. Viime vuosina Malinen on tehnyt yhteistyötä nuorten säveltäjien kanssa ja kantaesittänyt monia uusia teoksia sekä tehnyt useita radio- ja live-taltiointeja Yleisradiolle.